Podstawą rozwoju rynku biopaliw w Europie jest dyrektywa Parlamentu Europejskiego nr 2003/30/EC z 8 maja 2003 roku w sprawie promocji użycia biopaliw oraz odnawialnych źródeł energii dla celów transportowych, określająca minimalny udział biopaliw w ogólnym rynku paliwowym w kolejnych latach. Zakłada ona wzrost udziału biopaliw o 0,75% rocznie do poziomu 5,75% w roku 2010.

Dyrektywa ta pozostawia Państwom Członkowskim wolną rękę w zakresie wdrożenia legislacji promującej biopaliwa. W poszczególnych krajach europejskich stosuje się albo całkowite zwolnienie biodiesla z akcyzy (Austria, Belgia, Hiszpania), albo dopuszcza się kontyngenty zwolnione z podatku akcyzowego (Francja, Szwecja).

W Niemczech od 1 stycznia 2008 roku podatek akcyzowy został podwyższony do 15 eurocentów od litra biodiesla (dla porównania akcyza dla diesla wynosi 48 eurocentów za litr).

W Polsce stawki akcyzy reguluje Rozp. Ministra Finansów z dn. 22 grudnia 2006 r. zmieniające rozporządzenie w sprawie zwolnień od podatku akcyzowego. 11 maja 2007 r. uchwalono Ustawę o zmianie ustawy o podatku akcyzowym oraz o zmianie niektórych innych ustaw ustalającą korzystniejsze stawki akcyzy. Nie uzyskała ona jednak jeszcze akceptacji Komisji Europejskiej.

Spis ważniejszych przepisów prawnych dotyczących produkcji i sprzedaży estrów metylowych (biodiesla):

• Rozp. Rady Ministrów z dn. 15.06.2007 w sprawie Narodowych Celów Wskaźnikowych na lata 2008-2013, Dz.U. 2007 nr 110 poz. 757
• Ustawa z dn. 11.05.2007 o zmianie ustawy o podatku akcyzowym oraz o zmianie niektórych innych ustaw Dz.U. 2007 nr 99 poz. 666
• Rozp. Ministra Gospodarki z dn. 28 lutego 2007 w sprawie metod badania jakości biopaliw ciekłych Dz.U. 2007 nr 44 poz. 280 i 281
• Rozp. Ministra Gospodarki z dn. 22 stycznia 2007 w sprawie wymagań jakościowych dla biopaliw ciekłych stosowanych w wybranych flotach oraz wytwarzanych przez rolników na własny użytek Dz.U. 2007 nr 24 poz. 149
• Rozp. Ministra Finansów z dn. 22 grudnia 2006 zmieniające rozporządzenie w sprawie zwolnień od podatku akcyzowego Dz.U. 2006 nr 243 poz. 1766
• Rozp. Min. Gospodarki z dn. 8.09.2006 w sprawie wymagań jakościowych dla biopaliw ciekłych Dz.U. 2006 nr 166 poz. 1182
• Ustawa z dn.25.08.2006 r. o biokomponentach i biopaliwach ciekłych Dz.U. 2006 nr 169 poz. 1199
• Rozp. Min. Gospodarki i Pracy z dn. 19.10.2005 w sprawie wymagań jakościowych dla biokomponentów oraz metod badań jakości biokomponentów Dz.U. 2005 nr 218 poz. 1845
• Rozp. Min. Rolnictwa i Rozwoju Wsi z dn. 6.01.2004 w sprawie określenia jednostek certyfikujących oraz akredytowanych laboratoriów badawczych Dz.U. 2004 nr 2 poz. 12